摘要
本发明公开了一种空间转录组数据的解卷积方法,包括:步骤(1)对空间转录组数据和单细胞数据进行过滤,保留包含共同基因表达信息的部分;步骤(2)基于过滤后的单细胞数据及其对应的单细胞注释数据,统计各细胞类型的基因表达,计算每种细胞类型的平均基因表达水平,构建参考矩阵;步骤(3)以空间通讯及空间细胞组成作为决策变量,构建优化模型;步骤(4)以预测基因表达值与真实基因表达值之间的差异最小化为目标,应用优化算法对优化模型进行求解,得到空间解卷积与空间通讯模式的联合推断。本发明的方法及装置能够高精度地完成空间转录组数据的解卷积任务,同时实现对空间通讯的准确推断。
技术关键词
卷积方法
基因
数据
矩阵
通讯
邻居
决策
变量
网络
模式
算法
模块
坐标
代表
元素
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指标
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