摘要
本发明属于微纳尺度分子模拟技术领域,并公开了一种量化分子间氢键作用能的分子动力学模拟方法、系统、设备及介质,包括:通过分子动力学模拟软件建立待研究分子对应的分子模型;构建分子模型对应的晶胞复合模型;确定待研究分子在氢键相互作用过程中的供体和受体;基于预设环境参数和预设模拟时长对晶胞复合模型进行氢键相互作用模拟,并统计氢键相互作用模拟过程中的关键参数,所述关键参数包括平衡阱深参数、氢键供体受体原子距离和氢键供体受体原子键角;基于统计的关键参数计算氢键的相互作用能,得到氢键相互作用的动态变化数据。本发明能够揭示反应的微观进程,提高了对氢键作用能的认识并进一步解释微观现象的反应机理。
技术关键词
氢键相互作用
分子模型
动态变化数据
供体
受体
动力学模拟系统
参数
分子模拟技术
软件
存储计算机程序
电子设备
处理器
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命令
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