一种植物泛基因组外显子芯片的设计与应用方法

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一种植物泛基因组外显子芯片的设计与应用方法
申请号:CN202510319457
申请日期:2025-03-18
公开号:CN120099156A
公开日期:2025-06-06
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种植物泛基因组外显子芯片的设计与应用方法,旨在降低小麦等复杂基因组作物的基因组测序成本并提高测序效率。该技术包括以下步骤:一、通过迭代算法设计高效的液相捕获探针,确保探针能够覆盖目标基因组99%以上的外显子区域;二、采用算法计算分组合成外显子芯片原始探针模板;三、使用超微量扩增法制备液相捕获探针;四、通过分组梯度杂交法进行实验杂交确保目标区域的高效捕获;五、利用二代测序平台对捕获的样本进行高通量测序,获得高质量外显子区域数据。该技术可应用于小麦及其他复杂基因组作物的遗传研究、育种和全基因组选择等领域。通过优化探针设计、杂交探针制备、捕获方法,本发明显著降低了复杂基因组植物的测序成本,提高了基因组重要区域的覆盖度和数据准确性,适用于大规模植物基因组学研究、种质资源评估鉴定、大规模突变体库数字化。
技术关键词
基因组外显子芯片 捕获探针 二代测序平台 迭代算法 超微量 高通量测序平台 液相 捕获方法 序列特征 种质资源 突变体 模板 样本 数据 冗余
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