摘要
本发明涉及信息技术领域,公开一种基于三代测序用于HLA进行自动分析分型的方法;首先对待测样本的不同数据类型的第一测序读段数据的HLA类型进行初步判断,然后进行第二测序读段数据的选取,然后将识别出的不同的HLA类型的第二测序读段数据与对应的HLA参考序列进行比对验证和筛选,从而确定待测样本中存在的HLA类型;本发明的方法能够有效处理基于第三代测序技术产生的长读长数据,减小了精确比对的计算量,能够实现典型三代HLA数据在15分钟内的准确分析和报告生成,满足了进行快速HLA检测分析的需求;同时,该方法也能够针对二代测序获得的短读长数据进行分析,具有较好的数据兼容性。
技术关键词
数据
扩增子
基因
测序芯片
测序技术
矫正
重复序列
样本
位点
单倍体
纳米孔
软件
引物
核苷酸
算法
电信号
聚类
报告
典型