摘要
本发明涉及生物信息学技术领域,具体涉及一种基于eDNA宏基因组与宏条形码的检测生物多样性的方法。包括以下步骤:采集监测区域沉积物样本并提取eDNA;对提取的eDNA进行宏基因组高通量测序,得到宏基因组原始序列;对宏基因组原始序列进行质量控制,得到宏基因组质控序列;依据重复片段进行组装,得到宏基因组长序列;再根据特异性标记基因,筛选出查询序列并据此进行注释。与传统的生态系统野外调查方法相比,本发明应用了分子生物学方法,对于生物多样性的调查和监测更加高效、准确、全面,且对于生态系统和生物的干扰性小。
技术关键词
标记基因
序列
条形码
ITS2基因
生物信息学技术
分子生物学方法
隐马尔可夫模型
生态系统
高通量
调查方法
样本
采样点
参数
算法
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