一种基于向量量化的蛋白质结构表示方法

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一种基于向量量化的蛋白质结构表示方法
申请号:CN202510387916
申请日期:2025-03-31
公开号:CN120279980A
公开日期:2025-07-08
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于向量量化的蛋白质结构表示方法,包括:将蛋白质数据分为已知部分和未知部分,其中,已知部分包括已知蛋白质序列和已知蛋白质结构;针对已知部分,依次进行蛋白质序列结构编码和软条件向量量化处理,得到已知部分的量化后的表示;将已知部分的量化后的表示输入折叠符号生成模型FoldGPT,输出得到预测的量化表示;针对预测的量化表示进行蛋白质序列结构解码,生成未知部分的氨基酸残基及其空间结构。与现有技术相比,本发明能够实现蛋白质序列和三维结构信息的统一表示,提高蛋白质结构的重建质量,并支持高效、高精度的蛋白质序列和结构生成。
技术关键词
序列 三维空间结构 词嵌入技术 符号 多层感知机 神经网络模型 生成方式 数据编码 三维结构 阶段 索引 解码器 误差 数值
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