摘要
本发明公开了一种肝内胆管癌影像基因组学预测识别治疗新靶点的方法,包括以下步骤:S1、从公开数据库获取ICC患者的批量RNA‑seq数据及临床数据,共纳入401例患者,采用GeoMx™ DSP技术对40例患者的120个样本进行空间异质性分析,共分析240个ROI。本发明整合空间转录组学与影像组学来描述肿瘤内TIME异质性并预测治疗反应在胆管癌诊疗过程中具有较高的可行性与应用价值,本发明通过联合bulk、单细胞和空间转录组的多组学分析,鉴定出一种具有区域特异性的免疫相关生物标志物,可用于预测预后并筛选免疫化疗获益的优势人群,并且该生物标志物可通过影像组学联合机器学习方法实现无创精准预测。
技术关键词
肝内胆管癌
RNA‑seq数据
影像
小鼠PDX模型
机器学习方法
生物标志物
患者
深度学习特征
森林算法
队列
手工特征
基因
网络分析
小鼠模型
标记
免疫细胞
角蛋白
样本
肿瘤