一种基于FPGA芯片的FM-INDEX计算加速装置

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一种基于FPGA芯片的FM-INDEX计算加速装置
申请号:CN202510470565
申请日期:2025-04-15
公开号:CN120319303A
公开日期:2025-07-15
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于FPGA芯片的FM‑I NDEX计算加速装置,通过FPGA芯片利用其高度并行处理能力和可定制性,针对FM‑INDEX算法的关键操作进行硬件加速,大幅提高计算速度,降低延迟,DDR内存模块紧密连接FPGA,提供高速缓存功能,存储大量数据或索引,减少数据访问延迟,并通过合理存储结构设计实现单周期多碱基访问,PCI E引脚模块实现与计算机或服务器的高速通讯,无缝转移计算调度,充分利用FPGA计算能力,此外,装置提供外部烧录固件引脚,支持灵活更新或修复FPGA功能,增强可维护性和可扩展性,该装置在基因测序领域具有显著应用价值,满足大规模基因组数据实时比对需求,推动基因测序技术发展。
技术关键词
FPGA芯片 硬件逻辑单元 加速装置 动态资源分配 内存模块 烧写固件 存储结构设计 高速缓存功能 数据访问延迟 烧写器 LUT结构 基因测序技术 服务器 单周期 计算机 流水线技术 处理单元 处理器
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