一种GBeta-PMapping模型动态分配RNA LJ参数的方法

本发明公开了一种GBeta‑PMapping模型动态分配RNA LJ参数方法，包括：对从PDB数据库中获取全部RNA三维结构进行处理，形成配对和堆叠两种RNA核苷酸片段；制作高精度的RNA量子化学水平数据集，对所述两种RNA核苷酸片段进行量化计算，获得分子间相互作用能；制备训练GBeta模型的数据集，基于图神经网络GraphSAGE模型构建深度学习模型GBeta；基于粒子群优化算法、LJ映射函数理论和分子动力学模拟，获得最佳的映射函数模型PMapping；获取待分配LJ参数的RNA结构，将所述待分配的参数的RNA结构转换为待预测矩阵，通过训练好的深度学习模型对待预测矩阵进行预测，得到RNA分子中每个原子的电子云密度衰减系数(beta)，beta传入PMapping模型计算得到每个原子的LJ参数。