摘要
本发明提供了一种结核分枝杆菌传播关系探测系统及其应用,结合泛基因组学和机器学习算法,综合考虑菌株间的多种遗传差异和病例间流行病学信息,以更全面、精准的方式确定病例间的传播关系。通过样本采集、数据预处理,提取遗传差异、流行病学信息、菌株谱系等特征并进行整合归一化,再经数据划分、聚类分析、多种算法建模训练及评估筛选出最优模型,克服了固定SNP阈值误差,全面考量多种遗传变异类型,充分利用流行病学信息,实现传播概率定量评估,并能精准评估结核分枝杆菌的传播模式,实现结核分枝杆菌传播路径的溯源分析,具广泛适用性,为预防传播提供科学依据,提升防控效率与精准度,在全球结核病防控进程中发挥关键作用。
技术关键词
分析结核分枝杆菌
患者
分类系统
机器学习算法
随机森林
探测系统
时间差
关系
广义线性模型
结核病防控
核苷酸
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日期
位点
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