摘要
一种基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法,本发明涉及生物信息学和表观遗传学领域,具体涉及基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法。本发明解决现有hDMR识别精度低,统计模型过于简单,缺乏标准化流程的问题。过程为:1:获取一组人群中每个人的已排序的且带有甲基化信息的BAM文件;2:对BAM文件进行单倍型分型,得到分型后的hap1文件和hap2文件;3:对hap1文件和hap2文件进行单倍型差异甲基化区域的识别,得到1个人的候选印记区域;4:得到一个人群的候选印记区域;5:重复执行1至4得到另一组人群的候选印记区域;6:基于两个人群的候选印记区域得到两个人群分别的特异性印记区域。
技术关键词
区域检测方法
长读长测序
识别工具
染色体
软件
检测工具
位点
三代测序平台
参数
测序芯片
基因
电信号
标记
指令
矫正
索引
人类
定义
生物
频率