一种基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法

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正文
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一种基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法
申请号:CN202510524211
申请日期:2025-04-24
公开号:CN120472982A
公开日期:2025-08-12
类型:发明专利
摘要
一种基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法,本发明涉及生物信息学和表观遗传学领域,具体涉及基于长读长测序技术的人群特异性印记区域检测方法。本发明解决现有hDMR识别精度低,统计模型过于简单,缺乏标准化流程的问题。过程为:1:获取一组人群中每个人的已排序的且带有甲基化信息的BAM文件;2:对BAM文件进行单倍型分型,得到分型后的hap1文件和hap2文件;3:对hap1文件和hap2文件进行单倍型差异甲基化区域的识别,得到1个人的候选印记区域;4:得到一个人群的候选印记区域;5:重复执行1至4得到另一组人群的候选印记区域;6:基于两个人群的候选印记区域得到两个人群分别的特异性印记区域。
技术关键词
区域检测方法 长读长测序 识别工具 染色体 软件 检测工具 位点 三代测序平台 参数 测序芯片 基因 电信号 标记 指令 矫正 索引 人类 定义 生物 频率
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