摘要
本发明涉及生物技术领域,尤其涉及结直肠癌预后标志物、预后预测模型及其构建方法。本发明从癌症基因组图谱和基因表达综合数据库获取结直肠癌患者的基因表达数据,以及肿瘤免疫单细胞中心的单细胞RNA测序数据,选出224个缺氧和果糖代谢相关基因,通过回归分析和各种机器学习算法构建缺氧和果糖代谢相关基因评分系统,构建风险模型,从风险模型中初步选出8个与不良预后显著相关的基因,结合TCGA的转录组数据和人类蛋白质图谱数据库的蛋白质表达谱进行进一步验证,进行Kaplan‑Meier生存曲线、多因素回归分析、列线图构建和ROC曲线评估,确定P4HA1、ANKZF1和STC2关键预后基因,发现沙布托克能够与ANKZF1、STC2和P4HA1高亲和力结合,揭示沙布托克作为高风险患者的有前景的治疗选择。
技术关键词
预后检测产品
预后预测模型
结直肠癌患者
标志物
蛋白质表达水平
蛋白质表达谱
高通量测序平台
结直肠癌药物
差异表达分析
基因表达数据
综合数据库
风险
分子标签
机器学习算法
果糖
评分系统
图谱
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马尔科夫状态转移模型
矩阵
数据
网络拓扑结构
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脓毒症患者
淋巴细胞
风险分层
风险预测模型
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标志物
母猪配种
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咔啉