摘要
本发明公开了基于序列信息的DNA G‑四链体结构预测方法,包括以下步骤:S1)基于DNA G4的序列信息预测结构框架类型;S2)基于结构框架类型确定G‑茎区内碱基位置参数的映射关系,预测G‑茎区内碱基坐标,构建G‑茎区的全原子结构模型;S3)基于序列信息对连接各G‑片段的G‑环区结构建模,使用片段组装法构建多个结构完整的备选G4全原子模型;S4)通过模拟弛豫过程,对备选G4全原子模型能量最小化,并通过能量分数筛选得到结构稳定的G4全原子模型。本发明首次根据序列信息预测G4的全原子结构,为更好地了解这些G4的生物学功能,以及为基于G4结构的药物靶点发现、核酸探针设计等研究提供重要的基础。
技术关键词
四链体结构
结构框架
原子结构模型
坐标系
序列特征
分类器模型
参数
经验分布函数
建立决策树
关系
模拟工具
混合结构
直线
分子
核酸
探针
连线
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