摘要
本发明公开了一种华西牛无参贝叶斯基因组选择方法,所述方法包括:步骤一、构建参考群体并测定重要分类性状;步骤二、对华西牛采血保存,提取DNA并进行基因分型得到各个SNP位点的基因型;步骤三、对于华西牛个体,使用plink2软件将基因型文件和表型文件进行关联得到汇总统计数据;并将每个SNP位点根据染色体的位置进行分块以得到LD参考文件;步骤四,将汇总统计数据和LD参考文件作为无参贝叶斯模型的输入文件计算得到SNP位点的效应值;将候选个体的基因型向量与位点效应值向量相乘得到基因组估计育种值。本发明的目的是建立基于无参贝叶斯基因组选择技术的华西牛分类性状的选育方法,为优质华西牛的培育提供分子育种方法以推动肉牛种业的快速发展。
技术关键词
位点
贝叶斯模型
马尔科夫链蒙特卡洛方法
效应
染色体
分子育种方法
生物芯片
基因
选育方法
分块
软件
频率
参数
高密度
矩阵
数据