摘要
本发明属于核酸检测技术领域,具体涉及一种引物与探针的设计方法。本技术方案前置PTCD预测并由此筛选出候选扩增子区,有效避免了二级结构对引物结合的阻碍,提高扩增效率和灵敏度。同时,引入一系列PTCD与引物探针互作性的参数阈值,弥补了引物探针设计的缺失环节,设计在不同模板背景下的普适性和特异性。该方法适用于检测不同种属的基因表达、基因突变。此外,流程设计的标准化使其能够与CRISPR技术、单细胞测序、NGS等新技术结合,具有广阔的技术拓展空间。本技术方案通过优化引物和探针设计,规避了靶标核酸的二级结构,围绕PTCD,突破了引物探针设计的瓶颈,显著提高了多重qPCR和dPCR的扩增效率和检测灵敏度,具有重要的技术创新性和应用价值。
技术关键词
引物探针设计
扩增子
模拟工具
核酸序列信息
非线性
引物探针组合
核酸检测技术
PCR模板
折叠模型
稳态模型
茎环结构
靶标
发夹结构
核苷酸
侧翼
参数