一种基因-表型关联分析模型及其建立方法和应用

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一种基因-表型关联分析模型及其建立方法和应用
申请号:CN202510619297
申请日期:2025-05-14
公开号:CN120544671A
公开日期:2025-08-26
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基因‑表型关联分析模型及其建立方法和应用,属于生物医药技术领域。该模型建立方法包括:S1:收集已知关联的性状‑基因数据,构成基因‑性状对;S2:应用公式计算各基因罕见突变类型评分;S3:通过线性回归分析突变评分与性状的相关性,计算各突变类型权重,并优化权重组合,以相关性R2作为评估标准;S4:根据评分公式和优化权重,计算样本基因的罕见突变负荷分数;S5:通过回归方法,分析突变负荷分数与表型的关联性,构建基因‑表型关联分析模型。与传统gene‑base collapsing方法相比,本模型具有较好重现性和互补性,可用于发现新性状或未知疾病的候选风险基因。
技术关键词
逻辑回归方法 低密度脂蛋白胆固醇 疾病相关基因 线性回归方法 负荷 等位基因突变频率 原发性开角型青光眼 随机森林模型 非高密度脂蛋白 高密度脂蛋白胆固醇 超参数优化方法 年龄相关性黄斑变性 数据分析模块 数据存储模块 关联分析系统 上皮性卵巢癌 脂肪酸 双相情感障碍
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