摘要
本申请公开了组装IGHV短读长双端测序数据的方法,该方法包括获取IGHV短读长双端测序数据,通过免疫组库分析得到靶细胞测序数据;将靶细胞测序数据拆分为基于多种不同正向引物的双端读长数据;将第一正向引物的双端读长数据分为正向读长数据和反向读长数据,计算正向读长数据与第二正向引物的双端读长数据的最大公共序列;根据最大公共序列将正向读长数据与第二正向引物的双端读长数据组装;重复得到IGHV的全长序列。这种基于动态规划组装获取IGHV全长的方法,能适应短读长测序产生的免疫组库数据,从而实现快速、准确、低成本及便捷的IGHV突变检测。
技术关键词
引物
数据
序列
组装模块
动态规划算法
计算机可执行指令
聚类算法
可读存储介质
连续性
框架
处理器
频率
存储器
低成本