一种单细胞RNA-seq和ATAC-seq数据整合方法

本发明公开S1、采集scRNA‑seq的基因表达矩阵，scATAC‑seq的基因活性矩阵，以及scRNA‑seq的细胞类型注释；S2、对scRNA‑seq和scATAC‑seq数据进行预处理，获取scRNA‑seq和scATAC‑seq共有的基因；S3、构建编码器网络，实现不同组学数据在共享嵌入空间中的联合表征；S4、采用scRNA‑seq数据中的细胞类型标签对嵌入空间进行监督学习引导；S5、在嵌入空间和标签空间中，采用不平衡最优传输算法对scRNA‑seq与scATAC‑seq数据进行对齐；S6、根据匹配概率矩阵为scATAC‑seq数据中的每个细胞赋予细胞类型注释，并实现scRNA‑seq数据和scATAC‑seq数据的整合。解决了现有OT框架应用于单细胞数据整合导致生物学相关信号的失真，从而影响数据整合的准确性和可靠性的问题。