摘要
本发明属于电数字数据处理领域,具体涉及一种基于深度学习的基因表达缺失填补方法和系统,包括:将检测点划分为多个tile和spot;通过KNN算法对spot内缺少对表达基因表达的tile进行初步插补;从spot中选择tile构建正负样本,根据正负样本的群体特征嵌入表示通过对比学习模块对tile特征嵌入模块和spot特征嵌入模块进行训练;选择具有对该表达基因表达的且与待插补tile嵌入表示最相似的前I个tile作为待插补tile的相似tile;利用待插补tile的相似tile对表达基因的表达值对待插补tile进行重新插补。本发明提高了填补结果的局部一致性、准确性和空间连续性。
技术关键词
填补方法
检测点
基因
KNN算法
组织切片
样本
深度特征提取
编码器
编码模块
电数字数据处理
网格
输出特征
填补系统
注意力
矩阵
编码特征
邻居
度函数
软件
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