一种胚胎染色质开放性与基因表达评估方法

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一种胚胎染色质开放性与基因表达评估方法
申请号:CN202510685035
申请日期:2025-05-26
公开号:CN120823879A
公开日期:2025-10-21
类型:发明专利
摘要
本发明涉及胚胎发育评估技术领域,公开了一种胚胎染色质开放性与基因表达评估方法,包括以下步骤:通过显微操作技术提取存活率≥95%的胚胎细胞样本;采用ATAC‑seq技术获取染色质开放性信号数据;利用BWA比对工具进行基因组定位,结合Hi‑C数据通过矩阵分解算法构建三维接触矩阵;采用荧光定量PCR测定基因表达量;构建XGBoost集成学习模型融合染色质特征与基因表达数据。通过优化显微操作参数及ATAC‑seq实验流程,细胞存活率提高至95.2±1.3%,ATAC‑seq文库复杂度达85.3%,结合Hi‑C数据标准化处理,进而解决了数据偏差的技术问题,进而显著提升了胚胎样本处理效率与数据可靠性。
技术关键词
表达评估方法 胚胎 基因表达数据 矩阵分解算法 集成学习模型 TaqMan探针法 Pearson相关系数 梯度下降算法 颜色映射函数 双重验证机制 隐语义分析 预警机制 空间约束条件 双缓冲技术 滑动窗口算法 基因表达调控 AIC准则 三次样条插值
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