一种基于多组学标志物的高乙醇耐受酵母菌株的确定方法

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一种基于多组学标志物的高乙醇耐受酵母菌株的确定方法
申请号:CN202510692376
申请日期:2025-05-27
公开号:CN120998302A
公开日期:2025-11-21
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于多组学标志物的高乙醇耐受酵母菌株确定方法,涉及计算机技术领域。该方法包括:分别对多个未标注野生酵母菌株的基因表达量、蛋白质表达谱和代谢物丰度进行Z‑score标准化处理,并将Z‑score标准化处理后的三组数据按特征对齐;提取特征对齐后的三组数据的GRE1基因、TPS1基因、HSP104蛋白、ADH2蛋白、CTA1蛋白、鞘氨醇和海藻糖‑6‑磷酸的标准化值,根据提取的标准化值组成多组学生物标志物特征组合;将多组学生物标志物特征组合,输入菌株筛选模型进行工业菌株筛选,得到多个未标注野生酵母菌株中每一个的高乙醇耐受概率评分;将高乙醇耐受概率评分大于或等于预设阈值对应的菌株作为高乙醇耐受酵母菌株。该方法能够降低酵母菌株的筛选成本。
技术关键词
酵母菌株 工业菌株筛选 蛋白质表达 乙醇 样本 基因 矩阵 朴素贝叶斯模型 梯度提升决策树 海藻糖 广义线性模型 学生 特征选择 支持向量机模型 随机森林模型 酿酒酵母菌 数据 生物标志物
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