摘要
本发明属于单细胞测序技术领域,涉及全流程单细胞测序数据全自动处理方法及系统。所述系统包括:数据加载与浅拷贝模块:加载不同格式的单细胞数据集、内置示例数据;预处理流程标准化模块:使用Scanpy内建方法对数据加载与浅拷贝模块加载的数据进行预处理;关键参数自动搜索模块:依次采用集成Optuna和CMA‑ES两种优化策略对关键参数进行优化;降维与聚类分析模块:采用PCA技术进行降维,采用KNN构图构建细胞邻近图,采用Leiden聚类,调节Leiden聚类粒度参数resolution实现多粒度划分,并采用UMAP实现可视化,生成聚类图。本发明提供的系统为单细胞RNA测序数据分析提供了更加智能、可靠和高效的解决方案,具有广泛的技术推广价值和应用前景。
技术关键词
搜索模块
拷贝
格式
数据分析工具
基因
超参数
邻居
测序技术
聚类
优化器
策略
冗余
算法
接口
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