摘要
本发明涉及生物信息学技术领域,提供一种融合环境指示基因的作物全基因组表型预测方法及系统,该方法包括:采集重测序数据并进行基因组比对,得到变异位点数据;利用变异位点数据进行全基因组关联分析,得到表型关联位点信息;对作物群体材料在不同环境下的样本进行基因表达量测定,得到基因表达量数据;对基因表达量数据进行差异表达分析,以筛选环境指示基因,得到环境指示基因集合;构建双分支融合的表型预测模型;通过所述表型预测模型对待预测材料进行预测,获得针对不同环境的表型预测结果。本发明将环境因素纳入全基因组选择模型中,提高了不同环境下的表型预测精度。
技术关键词
差异表达基因
原始测序数据
差异表达分析
全基因组关联分析
位点
转录组测序技术
XGBoost算法
生物信息学技术
样本
融合特征
预测系统
分支
成分分析
分析模块
高通量
关系
数值