摘要
本发明公开了厚壳贻贝乌金壳色相关SNP分子标记及其应用,其中,分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,突变类型为G/A突变。分子标记方法包括:采集厚壳贻贝样本;利用颜色测量仪量化壳色表型;结合全基因组关联分析GWAS筛选出与乌金壳色显著关联的SNP候选位点;设计特异性引物,采用PCR扩增及一代测序技术;通过初筛和跨群体验证两阶段分析,最终确定稳定关联的SNP标记。本发明首次建立了厚壳贻贝乌金壳色SNP标记的低成本分型体系,较传统芯片检测成本大大降低,且通过大样本验证排除了假阳性干扰;该标记可直接用于分子标记辅助育种,加速高附加值乌金品系的选育,为壳色形成的遗传机制解析提供技术支撑。
技术关键词
全基因组关联分析
一代测序技术
颜色测量仪
分子标记开发方法
鉴定厚壳贻贝
核苷酸
引物
分子标记方法
分子标记辅助
两阶段
序列
样本
位点
低成本
机制
芯片