摘要
本发明公开了基于粪菌移植的治疗复发性艰难梭菌感染的微生物标志物及筛选方法,所述微生物标志物包括:Dorea longicatena、Alistipes putredinis、Citrobacter farmeri、Coprococcus comes、Eubacterium coprostanoligenes、Agathobacter rectalis、Dorea formicigenerans、Blautia obeum、Klebsiella oxytoca、Bacteroides fragilis、Blautiawexlerae、Bacteroides ovatus、Gemmigerformicilis、Faecalibacterium prausnitzii、Citrobacter freundii、Bacteroides xylanisolvens和Anaerostipes hadrus组合。本发明通过宏基因组测序和机器学习算法,筛选出粪菌移植治疗过程中与复发性艰难梭菌症状改善显著相关的关键微生物标志物,为粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染提供科学依据和标准化方案。
技术关键词
艰难梭菌感染
检测肠道
标志物筛选方法
建立预测模型
机器学习算法
样本
森林模型
序列
菌种
分箱
引物
数据
曲线
接头