摘要
本发明公开了一种TRIM相互作用蛋白的预测方法。本发明基于目前公开的文献收集TRIM‑target互作数据,结合肺腺癌(LUAD)的蛋白质组学和转录组学数据,构建了基于K近邻算法(KNN)的TRIM靶蛋白预测模型(LUAD‑TRIMCIVtargeter)。该预测模型在肺腺癌背景下展现出良好的预测性能,能有效识别TRIM CIV亚家族的特异性靶蛋白,在癌症研究中能够提供更精确的靶蛋白预测,为肿瘤发生机制的深入研究提供了强有力的工具。
技术关键词
K近邻算法
打分方法
差异表达分析
物理相互作用
样本
靶蛋白
构建预测模型
转录组学
数据
评分方法
核心算法
标签
基因
家族
坐标系
分子
直线
校正
机制