摘要
本发明公开了一种数据结构优化方法、心脏电生理仿真方法、装置、设备及介质,所述优化方法包括构建三维心脏组织模型并保存各细胞的坐标位置;按照GPU的线程束大小,对模型进行块划分并展开,得到包括稠密块、稀疏块和空块的细胞块;剔除所有空块,按照有效细胞数量对剩余细胞块进行降序排序;对降序排序后的细胞块进行融合和剔除处理,得到融合后的各细胞块;对融合后的各细胞块进行一维展开,并根据一维细胞序列中各细胞的坐标位置构建位置索引表。本发明避免了稀疏数据导致的空线程调度问题,避免了线程资源浪费,显著提高了GPU并行效率和计算吞吐量;同时,将空间上相近的细胞储存在相近的内存区域,提高了内存局部性,加速了GPU数据访问。
技术关键词
细胞块
心脏电生理
仿真方法
索引表
离子通道
内存
组织
优化装置
模型更新
序列
仿真模型
坐标
数据访问
状态更新
处理器
指令
可读存储介质
存储器