一种基于深度学习的脑切片三维重建与跨模态配准方法

本发明涉及一种基于深度学习的脑切片三维重建与跨模态配准方法，包括以下步骤：S1，执行切片操作前，对脑组织块表面进行拍照，得到块面图像，并将2D块面图像转换为3D块面图像；S2，采集荧光切片图像，并将所述荧光切片图像的模态迁移为块面模态；S3，将所述3D块面图像与活体状态下采集的MRI图像进行配准；S4，将模态迁移后的荧光切片图像与配准后的3D块面图像进行配准。本发明不仅能够提高配准精度，而且从图像预处理、配准、图谱映射到后续的神经元的映射重建流程实现了高度的自动化，显著降低了人工成本。