摘要
本发明属于生物技术领域,公开了大数据结合人工智能筛选植物互作蛋白及利用酵母双杂交验证蛋白互作的方法。本发明使用了AI结合大数据的方式,首先通过大数据筛选分析到家族蛋白的共表达蛋白。对这些蛋白进行AI互作预测与分子对接,进一步分析提取其互作信息。使用酵母双杂交或荧光共定位实验进一步分析筛选出的互作蛋白情况。本方法针对小麦等物种基因组复杂,且测序数据丰富的特点,创新性地利用公共测序数据进行亚基因组的互作蛋白筛选流程。解决蛋白筛库周期长,花销高,工作量大,筛选蛋白假阳性、无共表达等问题。快速便捷的得到重要的基因家族之间互作关系,准确清晰地找到互作结构域,为解析小麦关键基因功能机制研究提供技术支持。
技术关键词
筛选植物互作蛋白
转录组测序数据
家族
出发质粒
酵母
大数据
隐马尔可夫模型
诱饵
基因
对象
互作关系
标签
荧光
分子
序列
高频率
模式
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