基于原位杂交技术的图像处理方法、系统以及介质

本发明公开了基于原位杂交技术的图像处理方法、系统以及介质，涉及生物信息技术领域，包括：利用Z轴最大强度投影将细胞DAPI染色结果由三维转为二维数据，利用细胞分割从二维数据中识别和分离单个细胞，细胞分割在处理重叠区域时，使用配准算法Ashlar计算同一轮次的相邻视野间误差，得到细胞位置信息；对荧光探针与基因杂交后的成像结果通过配准算法Ashlar进行多轮次间配准生成拼接图像，利用荧光点识别算法对拼接图像在不同轮次下的局部最大值标记，从而得到每个荧光点的位置信息，将每个荧光点的位置信息与转录本中的基因对应，得到基因位置信息；利用所述细胞位置信息和所述基因位置信息，将基因分配到细胞中，得到细胞基因矩阵并展示；该图像处理方法、系统以及介质以实现测序数据与空间信息的精确匹配，进而更好的揭示基因表达在空间上的分布规律。