摘要
本发明属于空间转录组学技术领域,公开了一种基于空间转录组数据的组织结构聚类方法及相关装置,包括:获取空间转录组数据,并根据空间转录组数据构建基因表达矩阵,以及根据空间转录组数据中的spot位置坐标信息构建空间转录组数据图,并获取空间转录组数据图的归一化邻接矩阵;将归一化邻接矩阵和基因表达矩阵输入到预训练图卷积变分自编码器,得到空间转录组数据中各spot的嵌入表示;将各spot的嵌入表示进行聚类,得到各spot的聚类结果。有效提升组织结构聚类的聚类性能,实现了对组织空间结构的高精度分区,为空间异质性分析与功能区域识别提供了可靠支持。
技术关键词
聚类方法
构建基因表达
矩阵
编码器
重构
数据
联合损失函数
组织
Louvain算法
掩码策略
功能区域识别
球面
节点
聚类系统
可读存储介质
转录组学
轮廓系数
处理器