摘要
本发明提供了一种与椭圆果雪胆中雪胆素含量性状相关的SNP遗传标记及其应用,属于植物分子标记辅助育种与药用植物种子质量控制技术领域。本发明通过对椭圆果雪胆自然群体样本进行全基因组重测序与代谢物检测,基于全基因组关联分析方法,筛选并鉴定出20个SNP位点,所述SNP位点的等位基因频率为0.05~0.30,相关性P值均小于1×10‑8,显著性强,稳定性高。关联分析结果表明,所述SNP位点中的单一位点或组合位点能显著区分雪胆素高含量与低含量材料群体,具有较高的选择效率与稳定性。本发明的遗传标记可直接应用于椭圆果雪胆高含量雪胆素优质种质材料的筛选与评价,用于指导亲本选配和后代选种,提升雪胆素含量,具有重要的种质创新与产业推广价值。
技术关键词
SNP遗传标记
基因型检测方法
全基因组关联分析方法
植物分子标记辅助
雪胆素
药用植物种子
引物
种质创新
位点
试剂盒
样本
核苷酸
亲本
芯片
序列
模板
代表
程序