摘要
本发明公开了一种基于生成式预训练微调架构的抗脱靶效应从头药物分子设计方法,在预训练微调架构基础上,含以下步骤。步骤1:构建模型AgainstOTE‑R1,模型将靶向蛋白和随机选择的脱靶蛋白双受体作为输入,并经过随机移位的蛋白结构数据增强等模块进行训练;步骤2:构建模型AgainstOTE‑V1,模型将靶向蛋白和蛋白质语言模型选择的脱靶蛋白双受体作为输入,并根据基于分子动力学的蛋白结构数据增强等模块在AgainstOTE‑R1参数上进行微调;步骤3:模型推理,输入靶向蛋白,训练好的药物分子生成模块输出候选药物分子。经广泛实验验证,本方法设计的药物分子具有更优的理化性质和更强的抗脱靶效应能力。
技术关键词
药物分子设计方法
蛋白
脱靶效应
浅层神经网络
受体
模块
成分分析
亲和力
变换特征
数据
配体
有效性
节点特征
参数
级联
基准
样本