FPGA配置方法、系统及存储介质

本公开涉及计算机技术领域，公开了FPGA配置方法、系统及存储介质，该方法包括：上位机基于FPGA芯片的第一配置信息和配置版本，生成包含配置版本的第一阶段位流和第二阶段位流。上位机将第一阶段位流同步至FPGA芯片，以使FPGA芯片启动PCIe模块并将第一阶段位流的配置版本写入PCIe模块。上位机在PCIe模块启动的情况下，读取PCIe模块的第一阶段位流对应的配置版本，以及读取第二阶段位流的配置版本；若第一阶段位流的配置版本与第二阶段位流的配置版本一致，则上位机将第二阶段位流写入PCIe模块，以配置硬件逻辑电路。本公开能够解决因加载的第一阶段位流与第二阶段位流不匹配所导致的FPGA芯片异常的问题。