摘要
本发明涉及生物信息学技术领域,提供一种水稻多组织单细胞表达谱的可视化分析方法及系统。本发明的方法包括:对水稻组织的原始单细胞转录组的测序数据进行比对处理,得到标准化转录组数据集;对所述标准化转录组数据集进行批次效应校正并进行整合,得到全植株表达矩阵;对所述全植株表达矩阵进行细胞类型注释,得到细胞类型注释体系;将融合细胞类型注释体系的全植株表达矩阵进行可视化降维处理,并进行共表达网络构建,得到模块组织关联性分析模型;基于所述模块组织关联性分析模型建立交互端,通过交互端实现数据可视化分析。本发明为水稻细胞异质性研究、功能基因挖掘及分子育种提供了一站式分析平台。
技术关键词
可视化分析方法
可视化分析系统
组织
标记基因
矩阵
模块
React框架
XGBoost模型
图谱
数据可视化
RAP基因
数据下载功能
生物信息学技术
网络分析
交互式图表
基因表达数据
聚类
分子育种