病原体的判读方法、设备和介质

本申请提出一种病原体的判读方法、设备和介质，包括：对接收到的初始测序数据进行数据预处理，得到第一序列数据；将第一序列数据与预设病原体数据库中的参考基因组序列进行比对，得到比对结果；根据比对结果，得到初始测序数据的读段参数集；对读段参数集合进行病原体判读处理，得到初始测序数据对应的目标病原体类型；对目标病原体类型进行耐药基因检测，判断是否存在目标病原体对应的目标耐药基因；若存在，则对目标耐药基因进行分析，得到耐药数据；根据目标病原体类型、目标耐药基因和耐药数据，生成目标报告。本发明能够快速、准确地判读感染的病原体类型，并精确分析其耐药情况，以辅助临床医生制定合理的目标报告。