摘要
本发明公开一种基于进化聚类算法的分子构象生成方法及装置,本方法通过局部优化策略对输入的初始分子结构进行优化,获得优化后初始分子结构,并基于其生成初始种群;通过层次聚类策略进行聚类分析,获得若干结构簇;通过簇内最大距离进行判断,获得异常结构簇和正常结构簇;针对异常结构簇,将簇内的异常结构按照设定比例作为父代,进行种群迭代;针对正常结构簇,通过自适应进化策略对搜索策略进行优化,进行种群迭代;基于能量收敛标准及结构收敛标准,生成算法终止条件;当种群迭代满足算法终止条件或达到最大迭代次数,停止迭代;输出迭代过程中满足能量标准的分子构象,获得最终分子构象。本发明能够提升结构搜索的效率与智能化水平。
技术关键词
聚类算法
生成方法
进化策略
分子
密度泛函理论
生成装置
生成算法
表达式
矩阵
子模块
度量
顶点
动态
速率
参数
强度