一种基于FPGA的松树特有变异DNA片段高速分类系统及方法

一种基于FPGA的松树特有变异DNA片段高速分类系统及方法，它涉及一种松树特有变异DNA片段高速分类系统及方法。本发明为了解决现有技术中利用CPU或GPU进行松树变异DNA片段分析时存在的计算速度慢、能耗高、实时性差的问题。本发明所述分类系统数据输入接口模块，用于从外部存储或主机接收待分析的DNA序列数据及参考基因组序列数据，并将其载入至片上存储器；FPGA处理单元与所述数据输入接口模块和所述片上存储器相连，用于对所述DNA序列数据进行高速并行处理，并生成变异DNA片段的分类结果；结果输出接口模块，用于将所述分类结果从所述FPGA处理单元传输至外部主机或存储设备。本发明属于生物信息学和计算机硬件加速技术领域。