一种基于去噪扩散概率模型的空间基因表达插值方法

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一种基于去噪扩散概率模型的空间基因表达插值方法
申请号:CN202511062141
申请日期:2025-07-31
公开号:CN120564823B
公开日期:2025-09-26
类型:发明专利
摘要
本发明提出一种基于去噪扩散概率模型的空间基因表达插值方法,涉及基因数据表达领域,假设同一组织区域scRNA‑seq和ST测序数据具有相同或相似的基因表达模式。首先,通过两个马尔可夫链捕捉scRNA‑seq数据中基因表达丰度的关系:前向过程通过t个时间步向scRNA‑seq数据引入噪声,逆向过程通过基于注意力图卷积和Transformer的去噪网络恢复数据。然后将训练好的模型应用在ST数据上,在去噪过程中通过将缺失基因表达的ST数据引入,预测ST数据中缺失的部分,以补全转录组。本发明可以更加高效且准确地从scRNA‑seq参考数据中推断ST缺失的基因表达。
技术关键词
插值方法 基因表达数据 皮尔逊相关系数 随机噪声 插值模型 基因调控网络 基因表达模式 注意力机制 邻居 基因表达谱 矩阵 网络恢复 训练集 噪声数据 节点特征
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