摘要
本发明公开一种动物单细胞数据细胞类型注释方法,其特征在于,包括以下步骤:收集特定动物各组织、器官中纯化细胞类型的Bulk RNA‑seq数据,经预处理后整合为参考数据集;获取单细胞RNA‑seq 原始数据,对单细胞RNA‑seq 原始数据进行筛选得到高质量细胞,再从高质量细胞中再筛选出高变异基因,对高变异基因进行处理后提取主成分并对主成分降维,基于降维结果进行细胞聚类得到细胞簇;基于高变异基因计算细胞簇与参考数据集之间的表达相似度,根据相似度结果确定细胞簇的初始细胞类型,对得分接近的初始细胞类型进行迭代调优,得到最终的细胞类型注释结果。本发明为动物单细胞研究提供了高效且精准的技术支撑。
技术关键词
注释方法
动物
斯皮尔曼相关系数
Louvain算法
基因表达量差异
聚类
标志
基因鉴定方法
主成分分析降维
基因表达特征
富集
交互式可视化
差异表达分析
基因表达数据
注释系统
可视化系统
样本
格式
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