摘要
本发明公开了一种小麦泛基因组120K液相芯片及其应用。该芯片集成124,265条长度为90 bp的寡核苷酸探针,每条探针GC含量为0.3‑0.65、序列复杂度≥0.9、退火温度(Tm)≥68℃,不含N位点,单碱基串联重复数≤7,多碱基串联重复数≤3,全基因组比对中单探针匹配位点数不超过10。探针基于IWGSCv2.1、AK58、KN9204和JING411多个主流小麦基因组设计,通过严格的生物信息学质控及均匀布局,实现对多版本基因组的高覆盖和高多态性分型检测。该芯片适用于小麦品种分型、分子辅助育种、全基因组关联分析及种质资源评价,可为小麦及其他禾本科作物分子育种和遗传改良提供高效、精准的技术平台。
技术关键词
全基因组关联分析
多指标质控
种质资源评价
分子辅助育种
芯片
寡核苷酸探针
小麦品种
多态性位点
液相
序列
分子育种
复杂度
文库
布局
高通量
平台
分区