一种小麦泛基因组120K液相芯片及其应用

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一种小麦泛基因组120K液相芯片及其应用
申请号:CN202511129927
申请日期:2025-08-13
公开号:CN120866565A
公开日期:2025-10-31
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种小麦泛基因组120K液相芯片及其应用。该芯片集成124,265条长度为90 bp的寡核苷酸探针,每条探针GC含量为0.3‑0.65、序列复杂度≥0.9、退火温度(Tm)≥68℃,不含N位点,单碱基串联重复数≤7,多碱基串联重复数≤3,全基因组比对中单探针匹配位点数不超过10。探针基于IWGSCv2.1、AK58、KN9204和JING411多个主流小麦基因组设计,通过严格的生物信息学质控及均匀布局,实现对多版本基因组的高覆盖和高多态性分型检测。该芯片适用于小麦品种分型、分子辅助育种、全基因组关联分析及种质资源评价,可为小麦及其他禾本科作物分子育种和遗传改良提供高效、精准的技术平台。
技术关键词
全基因组关联分析 多指标质控 种质资源评价 分子辅助育种 芯片 寡核苷酸探针 小麦品种 多态性位点 液相 序列 分子育种 复杂度 文库 布局 高通量 平台 分区
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