一种牛SNP芯片及其应用

本发明属于生物技术领域，公开了一种牛SNP芯片及其应用，该液相芯片的检测对象包括定位于普通牛参考基因组ARS‑UCD 1.2上的7,829个SNP位点，SNP位点的位置信息如说明书表3所示。本发明提供的液相芯片突出西藏自治区地方牛品种特异性，通过分析地方牛群体结构，筛选能有效区分群体的位点，解决了商用芯片通用性强、特异性差的问题。该液相芯片还可实现位点灵活选择与升级，突破固相芯片无法灵活增补或更新位点的局限。整个方法可在样本量有限、种群结构复杂的前提下稳定运行，适合遗传资源保护和稀有品种的应用场景。还可拓展为标准化分型工具，适用于地方牛种质登记、品种认定、区域标识等多种应用。