一种基于混合注意力机制的冷冻电镜密度图精修方法

一种基于混合注意力机制的冷冻电镜密度图精修方法，属于生物信息学领域，首先构建包含实验密度图及其对应的原子结构的训练数据集，使用蛋白质大语言模型提取原子结构的特征嵌入表示，并根据原子结构生成对应的模拟密度图；然后将每个实验密度图与其对应的模拟密度图进行切块处理；接着，将实验密度图块和结构特征嵌入输入基于混合注意力机制的Transformer深度学习网络，生成预测密度图块；随后计算每组预测密度图块与对应模拟密度图块之间的损失差值，并通过反向传播差值更新网络参数；最后将待处理的冷冻电镜密度图切分为多个密度图块，经训练好的网络预测并组装，得到最终的精修密度图。本发明能够提高密度图的质量、鲁棒性较强。