摘要
本发明公开了生物信息学领域中生成针对靶标生物的siRNA前体双链RNA序列的方法及装置与应用。本发明所要解决的技术问题是如何设计针对于靶标物种的特异性siRNA的前体双链RNA。本发明分别基于转录组和蛋白质数据分析靶标物种的候选保守基因集进行基因保守性分析得到靶标物种的靶基因;然后基于靶基因的转录组数据截取所有前体双链RNA序列,并枚举所有可用序列片段获得候选双链RNA集合1;之后根据预设脱靶阈值从所述候选双链RNA集合1中筛选得到候选双链RNA集合2。本发明可应用于农业相关物种病原或害虫的RNAi防治。
技术关键词
基因
靶标
RNA二级结构
数据处理装置
植物病原真菌
滑动窗口法
序列比对算法
生物
线虫
分析模块
蛋白
农业
系统为您推荐了相关专利信息
压力调节设备
模糊逻辑
姿态控制方法
温湿度
非线性优化算法
胆固醇
ABCA1表达
稳态
调控靶点
基因敲除小鼠模型
神经网络模型
筛选方法
编译规则
基因
性能预测方法