摘要
本发明公开了多空间自监督对比学习的空间转录组数据空间域识别方法,包括:建模生成空间邻域图,保持图结构不变,打乱节点特征进行数据增强,作为增强图;基于图神经网络构建编码器,对融合了空间信息与基因信息的空间转录组数据进行提取得到潜在嵌入,送入多空间生成器以生成多组丰富的图特征表示;将图特征表示与潜在嵌入融合得到精炼的表示,通过解码器重构成基因表达矩阵,将对比学习损失和重建损失两者加和作为总目标函数;根据上述所得总目标函数,采用Adam优化器对网络参数进行更新,完成空间转录组空间域识别。本发明从全局和局部角度充分挖掘空间转录组数据,实现精确的空间域识别。
技术关键词
识别方法
多空间
矩阵
嵌入特征
编码器
节点特征
解码器
重构
邻域
基因表达特征
基因表达数据
位点
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