基于HLA基因的单细胞混样测序及样本拆分方法

本发明公开了一种基于HLA基因的单细胞混样测序及样本拆分方法。本发明首先获取每个待混样本的HLA基因分型信息；其次将待混样本混合后进行单细胞混样测序，获得混合样本的单细胞混样测序结果；最后基于所述HLA基因分型信息，通过计算所述单细胞混样测序序列中HLA基因的表达特征，鉴别每个细胞的样本来源，完成测序样本拆分。本发明突破了少细胞量临床样本无法进行单细胞测序的技术障碍，极大地提高了这些珍贵样本的利用率；通过高效的HLA基因序列伪比对算法显著降低了样本拆分的计算消耗；通过专注于人类基因组中多态性最高的HLA区域，提高了从低覆盖度细胞中获取遗传信息的能力；通过混样测序有效降低了单个样本的测序成本。