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FLYBOX

在动态沙盒中探索果蝇连接组

FLYBOX 是什么?

FLYBOX 是一款开源的交互式神经科学沙盒平台,内置一个拥有约 16.67 万个神经元和 2560 万个突触连接的果蝇大脑连接组模拟。研究者可以为虚拟果蝇提供食物、天敌、障碍物和光照等多种刺激,实时观察其神经活动与行为变化,并支持刺激或沉默特定神经群体、切断连接、分叉实验及不同大脑间的对比分析。

产品详细介绍

在动态沙盒中探索果蝇连接组

FLYBOX 是一款开源的交互式神经科学沙盒平台,内置一个拥有约 16.67 万个神经元和 2560 万个突触连接的果蝇大脑连接组模拟。研究者可以为虚拟果蝇提供食物、天敌、障碍物和光照等多种刺激,实时观察其神经活动与行为变化,并支持刺激或沉默特定神经群体、切断连接、分叉实验及不同大脑间的对比分析。

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创始人评论

Gaurav
Gaurav创始人

嘿,Product Hunt,

我开发了 FlyBox,这是一个围绕模拟果蝇神经连接组(包含 166,700 个神经元以及大约 2,560 万个突触)构建的开源交互式沙盒。

FlyBox 基于 Janelia/FlyEM 的 MaleCNS 神经连接组数据集以及 FlyBrain 项目。特别感谢 MaleCNS 数据集背后的研究人员,正是他们的工作使这一切成为可能。

FlyBox 并非仅仅可视化一个神经连接组,而是将其放入一个交互式环境之中。

你可以添加食物、天敌、障碍物、光照以及其他刺激,然后实时观察果蝇的反应。

模拟直接在你的浏览器中运行,使用你本地的 CPU/GPU,因此实际的模拟过程并不依赖服务器端算力。

你还可以直接与神经系统本身交互——刺激或沉默神经元集群、切断神经连接、查看实时的神经活动、分叉实验,以及比较不同轮次的运行结果。

FlyBox 有两种主要模式:

PLAY,用于与环境进行交互;

LAB,用于检查和操控神经活动。

这是一个实验性沙盒,并非声称能够完整复现果蝇的生物机制。其目标是让 connectome 规模的实验变得更加交互化,也更易于上手。

该项目完全开源。

非常期待听到你对模拟效果、界面设计的反馈,也欢迎大家建议接下来值得加入哪些实验。

主要的改动只是去掉了一些重复内容,并把 CPU/GPU 那一行说得更清楚一些。我会发布这个版本。

创始团队

Gaurav
Gaurav创始团队