一种基于泛癌多组学数据的无监督特征选择方法

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一种基于泛癌多组学数据的无监督特征选择方法
申请号:CN202410732519
申请日期:2024-06-07
公开号:CN118335206B
公开日期:2024-10-01
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于泛癌多组学数据的无监督特征选择方法,属于生物信息学领域,包括选择数据集及数据预处理;通过改进的谱聚类算法对S1得到的数据进行聚类,得到特征子集A;构建深度自动编码器,将S1得到的数据输入深度自动编码器得到特征子集B;对于特征子集B中的每一个特征,与特征子集A中所有特征计算Pearson相关系数,Pearson相关系数最高的特征Am作为结果,并在特征子集A中删除;评估最终得到的特征子集。本发明利用深度自动编码器指导的改进谱聚类无监督特征选择算法对未标记具体亚型的癌症样本做无监督特征选择,从中选择出对后续聚类分型有作用的重要基因特征,简化系统并提高亚型分类的准确性和可靠性。
技术关键词
监督特征选择方法 深度自动编码器 Pearson相关系数 轮廓系数 解码器 拉普拉斯 TCGA数据库 分析验证方法 样本 聚类 特征选择算法 重构 指数 矩阵 转录组学 基因 简化系统
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