一种基于交叉注意力机制的HLA和TCR分子抗原结合特异性预测算法

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一种基于交叉注意力机制的HLA和TCR分子抗原结合特异性预测算法
申请号:CN202410740825
申请日期:2024-06-07
公开号:CN118609664A
公开日期:2024-09-06
类型:发明专利
摘要
本发明基于深度学习技术在肿瘤抗原研发中的应用,结合了交叉注意力、自注意力和对抗学习等方法,提出了一种肿瘤抗原与T细胞受体(TCR)/人类白细胞抗原(HLA)结合特异性的算法,包括:序列嵌入、自注意力编码器提取序列特征、交叉注意力提取序列之间共同特征,肿瘤抗原结合预测、交叠训练。本发明首次使用交叠训练技术在肿瘤抗原结合特异性预测领域,交叉注意力分数揭示了肿瘤抗原结合到受体的关键氨基酸位点。总之,该方法标志着朝向全面评估抗原免疫原性的重要一步。
技术关键词
交叉注意力机制 肿瘤抗原 注意力编码器 HLAI类分子 关键氨基酸位点 人类白细胞抗原 算法 样本 深度学习技术 序列特征 数据标签 学习方法 基准 对抗性
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