一种基于自回归式模型的药物设计方法

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一种基于自回归式模型的药物设计方法
申请号:CN202410754023
申请日期:2024-06-12
公开号:CN118588196B
公开日期:2025-04-25
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于自回归式模型的药物设计方法,属于药物设计技术领域。该方法包括:将子词分词算法应用于生物学文本处理,对数据集中的蛋白质与配体信息进行训练,得到蛋白质和配体的分词器,并在此基础上构建自回归模型的分词器;处理并转化数据集中的原始数据为适用于自回归模型的文本形式,再通过所得分词器进行编码,构建自回归模型所需的训练数据集;利用训练数据集训练自回归模型,使其能理解配体的SMILES表示,并学习蛋白质与配体之间的相互作用模式;利用训练过的自回归模型生成预测的配体数据,并通过化学信息工具进行后处理,以获得具有具体化学结构的候选配体;对得到的候选配体进行评估和优化,以确定有潜力成为有效药物的候选分子。
技术关键词
药物设计方法 配体 分词算法 文本 数据 信息工具 蛋白 序列 格式 药物设计技术 深度学习框架 编码 分子 元素 生物 模式 基础 关系
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